<p>Hey Ryan,<br>
thanks for the response.</p>

<p>Unfortunately the program keeps hanging (but not as often as before):</p>

<hr>

<p>[DEBUG] Point 2 assigned to empty cluster 17.<br>
[INFO ] Cluster 18 is empty.<br>
[DEBUG] Point 3 assigned to empty cluster 18.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 1, residual inf.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 2, residual 0.197714.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 3, residual 0.151819.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 4, residual 0.0707789.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 5, residual 0.0748019.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 6, residual 0.0826282.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 7, residual 0.0555508.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 8, residual 0.0666275.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 9, residual 0.0591785.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 10, residual 0.0380067.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 11, residual 0.00518312.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 12, residual 0.00368832.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 13, residual 0.00231247.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 14, residual 0.00123067.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 15, residual 0.0035152.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 16, residual 0.00228494.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 17, residual 0.00522757.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 18, residual 0.0076554.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 19, residual 0.0119473.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 20, residual 0.0112805.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 21, residual 0.0219611.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 22, residual 0.0143273.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 23, residual 0.0118793.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 24, residual 0.0191215.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 25, residual 0.0221008.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 26, residual 0.0538075.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 27, residual 0.0694079.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 28, residual 0.0346496.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 29, residual 0.00939849.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 30, residual 0.00749252.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 31, residual 0.00635273.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 32, residual 0.00476996.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 33, residual 0.00516157.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 34, residual 0.00444851.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 35, residual 0.00304399.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 36, residual 0.00174719.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 37, residual 0.000555867.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 38, residual 0.000810098.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 39, residual 0.000738585.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 40, residual 0.00020829.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): iteration 41, residual 0.<br>
[INFO ] KMeans::Cluster(): converged after 41 iterations.<br>
[INFO ] 3280000 distance calculations.<br>
[DEBUG] Covariance matrix is not positive definite.  Adding perturbation.<br>
[DEBUG] EMFit::Estimate(): initial clustering log-likelihood: 10098.8<br>
[INFO ] EMFit::Estimate(): iteration 1, log-likelihood 10098.8.<br>
[INFO ] EMFit::Estimate(): iteration 2, log-likelihood inf.<br>
[DEBUG] Covariance matrix is not positive definite.  Adding perturbation.</p>

<hr>

<p>Greetings,<br>
Davud</p>

<p style="font-size:small;-webkit-text-size-adjust:none;color:#666;">&mdash;<br>Reply to this email directly or <a href="https://github.com/mlpack/mlpack/issues/496#issuecomment-171662644">view it on GitHub</a>.<img alt="" height="1" src="https://github.com/notifications/beacon/AJ4bFOX1eIPl8OwYDvRVtUYfghOsAL4rks5pZ607gaJpZM4G1xqM.gif" width="1" /></p>
<div itemscope itemtype="http://schema.org/EmailMessage">
<div itemprop="action" itemscope itemtype="http://schema.org/ViewAction">
  <link itemprop="url" href="https://github.com/mlpack/mlpack/issues/496#issuecomment-171662644"></link>
  <meta itemprop="name" content="View Issue"></meta>
</div>
<meta itemprop="description" content="View this Issue on GitHub"></meta>
</div>