<p>Okay, different Jenkins.  Thanks for the link.</p>

<p>Glancing at armadillo.rb, it is almost certainly not being built correctly with HDF5 support.  If you modify config.hpp before running CMake, then CMake will completely overwrite the changes that you made.  Take a look at Armadillo's CMakeLists.txt.  Instead, specify that you want HDF5 manually with the option <code>-DDETECT_HDF5=ON</code> and ensure that HDF5 and headers are installed on the system.  Checking the output of CMake to determine if HDF5 was found will ensure that your installation is correct.</p>

<p>The test failures I am seeing are these:</p>

<pre><code>/tmp/mlpack-pzGEIF/mlpack-mlpack-1.0.12/src/mlpack/tests/svd_batch_test.cpp:98: fatal error in "SVDBatchMomentumTest": critical check RMSE_2 &lt;= RMSE_1 failed [0.9185867037696458 &gt; 0.91157712642902167]
/tmp/mlpack-pzGEIF/mlpack-mlpack-1.0.12/src/mlpack/tests/svd_batch_test.cpp:149: fatal error in "SVDBatchRegularizationTest": critical check RMSE_2 &lt;= RMSE_1 failed [0.91787583628169389 &gt; 0.91157712642902167]
/tmp/mlpack-pzGEIF/mlpack-mlpack-1.0.12/src/mlpack/tests/svd_incremental_test.cpp:123: fatal error in "SVDIncompleteIncrementalRegularizationTest": critical check RMSE_2 &lt; RMSE_1 failed [0.92918024945339284 &gt;= 0.92886091107661617]
</code></pre>

<p>Are those the ones you are talking about?  If so, we should open a separate ticket for those, because the issue there may be somewhat complex.  I don't have an OS X system, so I can't reproduce or investigate, unfortunately.  That issue does not appear on any of the numerous Linux systems we have set up with our Jenkins setup.</p>

<p style="font-size:small;-webkit-text-size-adjust:none;color:#666;">&mdash;<br>Reply to this email directly or <a href="https://github.com/mlpack/mlpack/issues/403#issuecomment-74014453">view it on GitHub</a>.<img alt="" height="1" src="https://github.com/notifications/beacon/AJ4bFBexphxZSdwbE76NCPFgXs0_alceks5nrB51gaJpZM4DfUCf.gif" width="1" /></p>
<div itemscope itemtype="http://schema.org/EmailMessage">
  <div itemprop="action" itemscope itemtype="http://schema.org/ViewAction">
    <link itemprop="url" href="https://github.com/mlpack/mlpack/issues/403#issuecomment-74014453"></link>
    <meta itemprop="name" content="View Issue"></meta>
  </div>
  <meta itemprop="description" content="View this Issue on GitHub"></meta>
</div>